Listy máty peprné mají řadu příznivých vlastností, například protikřečové, protizánětlivé, antimikrobiální, uklidňující, analgetické, potopudné, protišokové, hojivé, močopudné, tonizující, dezodorační, expektorační, osvěžující a žlučopudné účinky.
Podporuje rozšíření mozkových a srdečních cév, zlepšuje chuť k jídlu a slinění, zvyšuje sekreci žaludečních a jaterních žláz a má trávicí účinky. Listy máty peprné jsou součástí různých přípravků, např. karminativních, choleretických, žaludečních, potopudných a sedativních. Zevně se doporučuje používat tinkturu z máty peprné k potírání při bolestech hlavy, migréně, zánětech kůže a svědění.
Odvary a nálevy z této rostliny se používají také zevně ve formě koupelí a obkladů ke zmírnění nervového napětí, neuralgických bolestí, nespavosti, sinusitidy, adnexitidy a chronické rýmy.
Výplachy nálevem se používají při zánětlivých onemocněních dutiny ústní, jako je zánět dásní a ústní dutiny, a také při bronchitidě, bronchiektáziích a bolestech zubů.
Nálevy mají antiseptické, analgetické a bronchodilatační účinky. V tradiční medicíně se čerstvá šťáva z listů máty peprné používá k léčbě onemocnění močového a žlučového systému, kolitidy, úplavice a bolestivé menstruace. Šťáva z máty peprné se používá také při uštknutí zvířetem a při uštknutí hadem a štírem.