Farmakologické účinky různých částí trnky se liší v závislosti na složení a množství biologicky aktivních látek, které obsahují.
Plody trnky, bez ohledu na jejich formu (čerstvé, ve formě želé, kompotů, rosolů, tinktur, odvarů nebo extraktů), mají stahující účinek a doporučují se k použití při gastrointestinálních onemocněních, jako je ulcerózní kolitida, úplavice, otrava jídlem a kandidóza.
Rakytníkové víno se považuje za léčebný nápoj při infekčních střevních onemocněních.
Čerstvá šťáva z trnek je vhodná při žloutence.
Přípravky z květů trnky upravují střevní motilitu, mají močopudné, diuretické a hypotenzní účinky. Zlepšují látkovou výměnu a jsou indikovány při gastritidě, spastické kolitidě, střevní atonii, cystitidě, otocích, ledvinových kamenech, revmatismu, vředech a jiných hnisavých kožních onemocněních, jakož i při zánětech sliznic úst, krku a jícnu.
Květy trnky se používají také v homeopatii.
Čaj z listů trnky má mírný projímavý účinek, zvyšuje vylučování moči, zlepšuje látkovou výměnu a používá se jako expektorans. Doporučuje se při chronické zácpě, ledvinových kamenech, zánětu močového měchýře, adenomu prostaty a kožních vyrážkách.
