Šalvěj má silné antiseptické vlastnosti, které se vysvětlují obsahem rostlinného antibiotika salvinu. Podporuje ničení zlatého stafylokoka a jeho metabolických produktů a má silnou protiplísňovou aktivitu.
Šalvěj lékařská má protizánětlivé, hemostatické, hojivé a stahující účinky. Posiluje epitel, zlepšuje funkci trávicího traktu a má mírný protikřečový účinek. Šalvěj také tonizuje srdeční sval, normalizuje metabolické procesy v těle a má pozitivní vliv na stav nervového a krvetvorného systému.
Tradičně se šalvěj používá k léčbě kašle, zánětů horních cest dýchacích a akutních infekcí dýchacích cest. Pomáhá také při angíně, bolestech v krku, spastické kolitidě a gastritidě s nízkou kyselostí.
Šalvěj se doporučuje při onemocněních zubů, jako je pulpitida, cheilitida, gingivitida, stomatitida a afty.
Tato rostlina se používá k přípravě hemostatických a protizánětlivých pleťových vod při zhoršení hemoroidů. Doporučuje se používat koupele s nálevem ze šalvěje k léčbě ekzémů, neurodermatitidy, lupénky a mykóz (kožních onemocnění způsobených plísněmi).
Je také součástí komplexní terapie chronických metabolických a dystrofických onemocnění kloubů, revmatismu, zánětů kloubů, ischiasu, deformující osteoartrózy a meziobratlové osteochondrózy.
