Szałwia ma silne właściwości antyseptyczne, które tłumaczy się zawartością roślinnego antybiotyku salwiny. Wspomaga niszczenie Staphylococcus aureus i jego produktów przemiany materii oraz wykazuje silne działanie przeciwgrzybicze.
Szałwia lekarska ma działanie przeciwzapalne, hemostatyczne, gojące i ściągające. Wzmacnia nabłonek, poprawia funkcjonowanie przewodu pokarmowego i ma lekkie działanie przeciwskurczowe. Szałwia tonizuje również mięsień sercowy, normalizuje procesy metaboliczne w organizmie oraz pozytywnie wpływa na stan układu nerwowego i krwiotwórczego.
Tradycyjnie szałwia stosowana jest w leczeniu kaszlu, stanów zapalnych górnych dróg oddechowych i ostrych infekcji dróg oddechowych. Pomaga również w przypadku zapalenia migdałków, bólu gardła, spastycznego zapalenia jelita grubego i zapalenia żołądka o niskiej kwasowości.
Szałwia jest zalecana w przypadku chorób zębów, takich jak zapalenie miazgi, zapalenie warg, zapalenie dziąseł, zapalenie jamy ustnej i zmiany aftowe.
Szałwia jest używana do przygotowywania hemostatycznych i przeciwzapalnych balsamów na zaostrzenie hemoroidów. Zaleca się stosowanie kąpieli z naparem z szałwii w leczeniu egzemy, neurodermitów, łuszczycy i grzybic (chorób skóry wywołanych przez grzyby).
Szałwia jest również częścią kompleksowej terapii przewlekłych metabolicznych i dystroficznych chorób stawów, reumatyzmu, zapalenia stawów, rwy kulszowej, deformującej choroby zwyrodnieniowej stawów i osteochondrozy międzykręgowej.