L’effet pharmacologique des différentes parties du prunellier varie en fonction de la composition et de la quantité de substances biologiquement actives qu’il contient.
Les fruits du prunellier, quelle que soit leur forme (frais, sous forme de gelée, de compote, de gelée, de teinture, de décoction ou d’extrait), ont un effet astringent et sont recommandés en cas de maladies gastro-intestinales telles que la colite ulcéreuse, la dysenterie, l’intoxication alimentaire et la candidose.
Le vin de prunelle est considéré comme une boisson thérapeutique en cas de maladies intestinales infectieuses.
Le jus frais des fruits du prunellier est bon contre la jaunisse.
Les préparations à base de fleurs de prunellier régulent la motilité intestinale, ont un effet diurétique, sudorifique et hypotenseur. Elles améliorent le métabolisme et sont indiquées en cas de gastrite, de colite spastique, d’atonie intestinale, de cystite, d’œdèmes, de calculs rénaux, de rhumatismes, de furoncles et d’autres maladies cutanées pustuleuses ainsi qu’en cas d’inflammation des muqueuses de la bouche, du pharynx et de l’œsophage.
Les fleurs de prunellier sont également utilisées en homéopathie.
Le thé de feuilles de prunellier a un léger effet laxatif, augmente l’élimination de l’urine, améliore le métabolisme et est utilisé comme expectorant. Elle est recommandée en cas de constipation chronique, de néphrolithiase, de cystite, d’adénome de la prostate et d’éruptions cutanées.