Šalvia má silné antiseptické vlastnosti, ktoré sa vysvetľujú obsahom rastlinného antibiotika salvínu. Podporuje ničenie zlatého stafylokoka a jeho metabolických produktov a má silnú protiplesňovú aktivitu.
Šalvia lekárska má protizápalové, hemostatické, hojivé a sťahujúce účinky. Posilňuje epitel, zlepšuje činnosť tráviaceho traktu a má mierny protikŕčový účinok. Šalvia tiež tonizuje srdcový sval, normalizuje metabolické procesy v tele a pozitívne pôsobí na stav nervového a krvotvorného systému.
Tradične sa šalvia používa na liečbu kašľa, zápalov horných dýchacích ciest a akútnych infekcií dýchacích ciest. Pomáha aj pri angíne, bolestiach hrdla, spastickej kolitíde a gastritíde s nízkou kyslosťou.
Šalvia sa odporúča pri ochoreniach zubov, ako sú pulpitída, cheilitída, gingivitída, stomatitída a afty.
Táto rastlina sa používa na prípravu hemostatických a protizápalových pleťových vôd pri zhoršení hemoroidov. Odporúča sa používať kúpele s nálevom šalvie na liečbu ekzémov, neurodermatitídy, psoriázy a mykóz (kožné ochorenia spôsobené hubami).
Je tiež súčasťou komplexnej terapie chronických metabolických a dystrofických ochorení kĺbov, reumatizmu, zápalov kĺbov, ischias, deformujúcej osteoartrózy a medzistavcovej osteochondrózy.