Fenikel má liečivé vlastnosti, ktoré mu umožňujú uvoľniť kŕče hladkého svalstva žalúdka a čriev. Okrem toho podporuje tvorbu žlče v tráviacom trakte. Plody feniklu sú obľúbené pri liečbe plynatosti, pretože uľahčujú pohyb čriev a môžu spôsobiť mierny diuretický účinok.
U žien môže fenikel stimulovať tvorbu mlieka počas laktácie a lieky na báze feniklu sa úspešne používajú ako pomocný prostriedok pri liečbe oneskorenej menštruácie a menštruačných bolestí. Okrem toho sa odporúčajú pri zápaloch mliečnych žliaz.
Fenikel má aj ďalšie liečivé vlastnosti, napríklad schopnosť odstraňovať zápaly pri ochoreniach dýchacích ciest.
Vonkajšie použitie plodov feniklu je spôsobené ich antimikrobiálnymi vlastnosťami. Masti, prášky, obklady a kúpele z tohto rastlinného materiálu môžu podporiť rýchle hojenie kožných lézií.
Fenikel pomáha aj pri liečbe vonkajších prejavov neurodermatitídy a pustulóznych kožných lézií, pričom má mierny sedatívny účinok. Okrem toho sa používa pri očných ochoreniach, pretože má antibakteriálny účinok a zabraňuje tvorbe hnisavého výtoku.