Як лікарський засіб використовують надземну частину рослини. Препарати материнки застосовують як відхаркувальний, протизапальний засіб, тому їх використовують при захворюваннях верхніх дихальних шляхів, в тому числі інфекційних і вірусних. Рослина має бактерицидні властивості й усуває запалення, больові відчуття в горлі. Вміст тимолу в траві материнки забезпечує зміцнення імунітету, покращує захисні функції організму, прискорює регенерацію пошкоджених тканин, виводить токсичні речовини.
Материнка є профілактичним засобом від старіння шкіри. Антибактеріальна дія трави знімає подразнення і запалення, допомагає від прищів й висипів, покращує її еластичність і забезпечує гладкість, надає рівномірну засмагу та допомагає розгладити зморшки.
Застосовують материнку при різних розладах шлунково-кишкового тракту, використовують при запорах як проносний засіб з помірною дією.
Лікувальні властивості материнки включають заспокійливу дію на нервову систему. Використання трави рослини знижує тривожність, дратівливість, покращує сон, знімає ознаки втоми, застосовують як легке снодійне, допомагає усунути набряклість.
У складі материнки звичайної присутня елагова кислота – компонент із вираженою антиоксидантною дією, забезпечує протизапальні й кровоспинні властивості препаратів цієї трави.
Материнка застосовується як пряність у кулінарії (під назвою Орегано). Спеції з материнки надають страві приємного запаху та підвищують апетит.
Використовують рослину при хворобливих місячних, при порушеннях менструального циклу. Також стимулює гладеньку мускулатуру матки, затримує виникнення клімаксу і допомагає при його симптомах, поліпшує роботу яєчників, збільшує лактацію у матерів, що годують.