Heřmánek má protizánětlivé, potopudné, sedativní, hemostatické a analgetické účinky. Tato rostlina pomáhá uvolňovat křeče, urychluje proces regenerace epitelu, zastavuje hnilobu a kvašení ve střevech, pomáhá stimulovat trávení a má dezinfekční vlastnosti. Heřmánek je díky obsahu hamazulenu také protialergickým lékem. Glykosidy obsažené v heřmánku uvolňují hladké svalstvo a mají účinek podobný atropinu.
Za zmínku stojí také to, že heřmánek má antivirové účinky, které pomáhají při nachlazení. Urychluje proces hojení, zmírňuje příznaky a zmírňuje zánět sliznice. Heřmánek lze použít jako kloktadlo při bolestech v krku, laryngitidě, angíně nebo zánětu úst.
V případě chronických bronchopulmonálních onemocnění a bronchiálního astmatu může být užitečná inhalace heřmánku.
Heřmánek má protizánětlivé vlastnosti, které mohou být užitečné při potížích, jako je zánět spojivek, ječmene a zarudlých očí. K výplachům očí můžete použít heřmánkový nálev nebo čaj. Také v případě zánětu kloubů a zhoršení dny mohou heřmánkové koupele nebo obklady na postižené místo pomoci zklidnit stav.